S’étirant sur toute la longueur du Jura comtois, cette région à la topographie imparfaitement plane est accidentée de rides alignées qui, comme la montagne de Gilley ou les chaînons du faisceau de Syam, préfigurent les plissements de la haute chaîne. Bien développé au nord, entre Doubs et Dessoubre, ce plateau calcaire se fragmente et se resserre vers le sud par la combe et la vallée de l’Ain. Dans le Jura, le plateau de Nozeroy, aux paysages très ouverts, tranche avec la zone des lacs où les anciens glaciers ont façonné le paysage et laissé des plans d’eau résiduels. Avec des altitudes comprises entre 800 et 950 mètres, le second plateau abrite de beaux massifs forestiers dominés par la hêtraie-sapinière. La région est parsemée de tourbières acides, comme celles des environs du Russey et de Frasne.