Cette unité, dont l’altitude varie de 600 à 800 mètres du sud vers le nord, s’étend de la chaîne du Lomont à la vallée de la Loue, puis se prolonge vers le sud jusqu’à la reculée de Baume-les-Messieurs. La dalle calcaire est marquée par la diversité des formes de dissolution karstique superficielles : dolines, vallons aveugles, lapiaz, gouffres… La partie sud de ce plateau incliné est recouverte par de vastes forêts de chêne et de charme, puis on trouve plus au nord des forêts mélangées de chênes, hêtres et charmes, tandis qu’à l’approche de la chaîne du Lomont, la hêtraie-sapinière domine. Ce passage progressif d’une végétation de type collinéen à une végétation de type montagnard est dû en grande partie à l’inclinaison de ce plateau. Le restant du plateau est occupé par des prairies et des grands massifs forestiers. Le marais de Saône, à proximité de Besançon, constitue une belle zone humide de 800 ha au fonctionnement original (inondations fortes) rappelant celui des grandes vallées inondables.